Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HADHAP40939 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HADHAP40939 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HADHAP40939 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHAP40939 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHAP40939 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHAP40939 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHAP40939 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHAP40939 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HADHAP40939 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHAP40939 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHAP40939 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHAP40939 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HADHAP40939 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHAP40939 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHAP40939 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HADHAP40939 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HADHAP40939 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHAP40939 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HADHAP40939 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHAP40939 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHAP40939 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHAP40939 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HADHAP40939 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HADHAP40939 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHAP40939 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHAP40939 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHAP40939 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHAP40939 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHAP40939 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHAP40939 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HADHAP40939 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHAP40939 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HADHAP40939 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HADHAP40939 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HADHAP40939 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHAP40939 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHAP40939 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHAP40939 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHAP40939 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HADHAP40939 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms