Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH1P40692 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH1P40692 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH1P40692 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH1P40692 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH1P40692 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MLH1P40692 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH1P40692 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH1P40692 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH1P40692 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH1P40692 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MLH1P40692 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MLH1P40692 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH1P40692 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH1P40692 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MLH1P40692 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH1P40692 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH1P40692 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH1P40692 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH1P40692 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MLH1P40692 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH1P40692 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH1P40692 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH1P40692 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH1P40692 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH1P40692 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH1P40692 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MLH1P40692 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH1P40692 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH1P40692 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH1P40692 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH1P40692 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH1P40692 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MLH1P40692 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MLH1P40692 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MLH1P40692 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MLH1P40692 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH1P40692 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH1P40692 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH1P40692 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH1P40692 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MLH1P40692 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MLH1P40692 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MLH1P40692 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MLH1P40692 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MLH1P40692 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MLH1P40692 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MLH1P40692 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MLH1P40692 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MLH1P40692 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MLH1P40692 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MLH1P40692 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MLH1P40692 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MLH1P40692 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MLH1P40692 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MLH1P40692 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MLH1P40692 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLH1P40692 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MLH1P40692 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MLH1P40692 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms