Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFI27P40305 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFI27P40305 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFI27P40305 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFI27P40305 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFI27P40305 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFI27P40305 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFI27P40305 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFI27P40305 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFI27P40305 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFI27P40305 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFI27P40305 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFI27P40305 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFI27P40305 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFI27P40305 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFI27P40305 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IFI27P40305 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IFI27P40305 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IFI27P40305 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFI27P40305 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFI27P40305 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFI27P40305 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFI27P40305 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFI27P40305 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IFI27P40305 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IFI27P40305 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFI27P40305 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IFI27P40305 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms