Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1AP37088 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1AP37088 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms