Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACVR1BP36896 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACVR1BP36896 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACVR1BP36896 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACVR1BP36896 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACVR1BP36896 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ACVR1BP36896 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1BP36896 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1BP36896 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1BP36896 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACVR1BP36896 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352.5 ms