Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP214P35658 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP214P35658 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP214P35658 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP214P35658 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP214P35658 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP214P35658 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP214P35658 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP214P35658 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP214P35658 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP214P35658 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP214P35658 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP214P35658 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP214P35658 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP214P35658 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP214P35658 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP214P35658 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP214P35658 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP214P35658 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP214P35658 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP214P35658 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP214P35658 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP214P35658 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP214P35658 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP214P35658 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP214P35658 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP214P35658 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP214P35658 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP214P35658 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP214P35658 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP214P35658 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP214P35658 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP214P35658 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP214P35658 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP214P35658 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP214P35658 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP214P35658 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms