Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCK1P35558 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCK1P35558 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCK1P35558 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCK1P35558 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCK1P35558 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCK1P35558 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCK1P35558 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCK1P35558 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCK1P35558 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCK1P35558 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCK1P35558 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCK1P35558 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCK1P35558 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCK1P35558 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCK1P35558 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCK1P35558 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCK1P35558 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCK1P35558 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCK1P35558 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCK1P35558 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCK1P35558 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCK1P35558 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCK1P35558 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCK1P35558 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCK1P35558 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCK1P35558 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCK1P35558 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCK1P35558 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCK1P35558 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCK1P35558 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCK1P35558 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCK1P35558 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCK1P35558 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCK1P35558 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCK1P35558 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCK1P35558 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCK1P35558 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCK1P35558 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCK1P35558 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCK1P35558 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCK1P35558 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCK1P35558 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCK1P35558 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCK1P35558 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCK1P35558 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCK1P35558 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCK1P35558 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCK1P35558 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCK1P35558 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCK1P35558 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCK1P35558 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCK1P35558 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCK1P35558 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCK1P35558 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCK1P35558 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCK1P35558 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCK1P35558 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCK1P35558 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCK1P35558 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCK1P35558 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms