Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSP1P33241 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LSP1P33241 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LSP1P33241 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSP1P33241 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSP1P33241 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSP1P33241 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSP1P33241 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSP1P33241 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSP1P33241 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSP1P33241 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSP1P33241 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSP1P33241 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSP1P33241 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LSP1P33241 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSP1P33241 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSP1P33241 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSP1P33241 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSP1P33241 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSP1P33241 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSP1P33241 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSP1P33241 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSP1P33241 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSP1P33241 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSP1P33241 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSP1P33241 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSP1P33241 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSP1P33241 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LSP1P33241 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSP1P33241 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSP1P33241 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSP1P33241 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSP1P33241 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSP1P33241 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSP1P33241 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSP1P33241 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSP1P33241 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSP1P33241 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSP1P33241 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSP1P33241 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSP1P33241 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSP1P33241 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSP1P33241 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSP1P33241 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSP1P33241 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSP1P33241 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSP1P33241 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSP1P33241 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSP1P33241 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSP1P33241 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.9 ms