Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCR5P32302 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CXCR5P32302 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms