Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCKBRP32239 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKBRP32239 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms