Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXA13P31271 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA13P31271 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA13P31271 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms