Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXA11P31270 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA11P31270 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA11P31270 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms