Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CLIP1P30622 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CLIP1P30622 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CLIP1P30622 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CLIP1P30622 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms