Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF8P28908 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TNFRSF8P28908 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF8P28908 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms