Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1EP28566 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1EP28566 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1EP28566 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HTR1EP28566 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1EP28566 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTR1EP28566 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTR1EP28566 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms