Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 40
DDX6P26196 EPHB4-205ENST00000478459 965 ntTSL 220.28■□□□□ 0.842e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 519.26■□□□□ 0.677e-18■■■■■ 40
DDX6P26196 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.457e-18■■■■■ 40
DDX6P26196 EPHB4-203ENST00000467515 709 ntTSL 217.15■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-16■■■■■ 40
DDX6P26196 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 40
DDX6P26196 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 DAB2IP-203ENST00000373782 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 CTTN-213ENST00000529736 952 ntTSL 314.61□□□□□ -0.077e-18■■■■■ 40
DDX6P26196 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.087e-18■■■■■ 40
DDX6P26196 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 40
DDX6P26196 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 40
DDX6P26196 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.397e-18■■■■■ 40
DDX6P26196 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 ZNF507-202ENST00000355898 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-13■■■■■ 40
DDX6P26196 DAB2IP-207ENST00000459906 485 ntTSL 310.85□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 40
DDX6P26196 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-13■■■■■ 40
DDX6P26196 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 40
DDX6P26196 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.351e-13■■■■■ 40
DDX6P26196 ZNF507-205ENST00000587084 5560 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.571e-13■■■■■ 40
DDX6P26196 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.912e-6■■■■■ 40
DDX6P26196 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 39.6
DDX6P26196 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 39.2
DDX6P26196 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 39.2
DDX6P26196 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 39.2
DDX6P26196 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 510.69□□□□□ -0.72e-18■■■■■ 38.9
DDX6P26196 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 38.8
DDX6P26196 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 38.8
DDX6P26196 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.273e-6■■■■■ 38.8
DDX6P26196 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 38.8
DDX6P26196 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 38.8
DDX6P26196 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 38.8
DDX6P26196 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.097e-11■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.453e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 ANAPC11-205ENST00000571570 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 38.7
DDX6P26196 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.021e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.251e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 CPNE7-203ENST00000525982 576 ntTSL 522.64■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 EHBP1L1-205ENST00000529099 490 ntTSL 521.78■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 11e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 TUBG1-205ENST00000591509 847 ntTSL 321.13■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-210ENST00000637920 1093 ntTSL 219.85■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 TLE3-217ENST00000559574 325 ntTSL 519.78■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-203ENST00000413013 806 ntTSL 218.93■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 218.83■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-204ENST00000463083 1487 ntTSL 218.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MIB2-206ENST00000467597 776 ntTSL 218.78■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 KLC2-212ENST00000526758 594 ntTSL 418.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MIB2-222ENST00000507229 2582 ntTSL 218.35■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MIB2-230ENST00000514363 592 ntTSL 318.15■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 218.08■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 517.48■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 38.6
DDX6P26196 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 38.6
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 111.2 ms