Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTX3P26022 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTX3P26022 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTX3P26022 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTX3P26022 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTX3P26022 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTX3P26022 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTX3P26022 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTX3P26022 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTX3P26022 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTX3P26022 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTX3P26022 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTX3P26022 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTX3P26022 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTX3P26022 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTX3P26022 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTX3P26022 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTX3P26022 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PTX3P26022 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTX3P26022 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTX3P26022 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTX3P26022 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTX3P26022 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTX3P26022 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTX3P26022 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTX3P26022 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTX3P26022 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTX3P26022 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTX3P26022 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTX3P26022 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTX3P26022 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTX3P26022 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTX3P26022 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTX3P26022 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTX3P26022 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTX3P26022 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTX3P26022 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTX3P26022 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTX3P26022 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTX3P26022 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTX3P26022 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTX3P26022 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTX3P26022 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms