Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NFKBIAP25963 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFKBIAP25963 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFKBIAP25963 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms