Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRM1P23921 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRM1P23921 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRM1P23921 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRM1P23921 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRM1P23921 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRM1P23921 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRM1P23921 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRM1P23921 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRM1P23921 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRM1P23921 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRM1P23921 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRM1P23921 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRM1P23921 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RRM1P23921 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRM1P23921 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRM1P23921 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRM1P23921 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRM1P23921 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRM1P23921 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRM1P23921 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRM1P23921 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRM1P23921 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRM1P23921 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRM1P23921 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRM1P23921 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRM1P23921 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRM1P23921 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRM1P23921 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRM1P23921 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRM1P23921 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRM1P23921 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRM1P23921 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRM1P23921 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRM1P23921 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRM1P23921 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRM1P23921 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRM1P23921 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRM1P23921 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRM1P23921 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRM1P23921 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRM1P23921 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRM1P23921 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRM1P23921 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRM1P23921 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRM1P23921 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRM1P23921 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRM1P23921 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms