Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGA6P23229 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGA6P23229 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGA6P23229 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms