Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP6V1B2P21281 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP6V1B2P21281 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms