Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A1P20849 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL9A1P20849 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL9A1P20849 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms