Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASTP20810 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASTP20810 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASTP20810 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASTP20810 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASTP20810 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASTP20810 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASTP20810 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASTP20810 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASTP20810 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASTP20810 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASTP20810 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASTP20810 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASTP20810 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASTP20810 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASTP20810 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASTP20810 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CASTP20810 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CASTP20810 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASTP20810 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASTP20810 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASTP20810 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASTP20810 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASTP20810 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASTP20810 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASTP20810 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASTP20810 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASTP20810 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASTP20810 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASTP20810 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASTP20810 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASTP20810 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASTP20810 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASTP20810 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASTP20810 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASTP20810 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASTP20810 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASTP20810 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASTP20810 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASTP20810 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CASTP20810 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASTP20810 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CASTP20810 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASTP20810 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASTP20810 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASTP20810 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASTP20810 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASTP20810 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASTP20810 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASTP20810 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASTP20810 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASTP20810 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASTP20810 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASTP20810 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASTP20810 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASTP20810 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASTP20810 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CASTP20810 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASTP20810 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASTP20810 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASTP20810 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASTP20810 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASTP20810 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASTP20810 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASTP20810 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASTP20810 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASTP20810 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASTP20810 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASTP20810 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASTP20810 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASTP20810 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASTP20810 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASTP20810 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CASTP20810 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASTP20810 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASTP20810 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms