Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP4AP20648 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP4AP20648 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms