Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF1BP20333 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFRSF1BP20333 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFRSF1BP20333 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFRSF1BP20333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms