Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DPA1P20036 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DPA1P20036 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DPA1P20036 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms