Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LBPP18428 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LBPP18428 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LBPP18428 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LBPP18428 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBPP18428 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBPP18428 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBPP18428 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LBPP18428 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LBPP18428 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LBPP18428 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBPP18428 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBPP18428 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBPP18428 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBPP18428 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LBPP18428 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LBPP18428 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LBPP18428 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBPP18428 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBPP18428 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBPP18428 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBPP18428 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBPP18428 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBPP18428 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LBPP18428 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBPP18428 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBPP18428 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBPP18428 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBPP18428 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LBPP18428 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LBPP18428 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms