Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF43P17038 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms