Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB3P16520 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB3P16520 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB3P16520 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB3P16520 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GNB3P16520 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB3P16520 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GNB3P16520 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB3P16520 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB3P16520 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB3P16520 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GNB3P16520 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GNB3P16520 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB3P16520 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB3P16520 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB3P16520 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB3P16520 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB3P16520 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GNB3P16520 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB3P16520 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB3P16520 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB3P16520 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB3P16520 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB3P16520 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB3P16520 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB3P16520 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB3P16520 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB3P16520 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GNB3P16520 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNB3P16520 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNB3P16520 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms