Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GATA1P15976 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATA1P15976 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATA1P15976 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATA1P15976 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATA1P15976 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATA1P15976 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATA1P15976 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GATA1P15976 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATA1P15976 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATA1P15976 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GATA1P15976 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA1P15976 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA1P15976 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA1P15976 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GATA1P15976 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GATA1P15976 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GATA1P15976 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GATA1P15976 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GATA1P15976 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GATA1P15976 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA1P15976 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA1P15976 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA1P15976 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GATA1P15976 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA1P15976 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA1P15976 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GATA1P15976 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms