Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MUC1P15941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MUC1P15941 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MUC1P15941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MUC1P15941 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MUC1P15941 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MUC1P15941 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MUC1P15941 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MUC1P15941 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MUC1P15941 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MUC1P15941 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MUC1P15941 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MUC1P15941 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MUC1P15941 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MUC1P15941 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MUC1P15941 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MUC1P15941 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MUC1P15941 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MUC1P15941 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MUC1P15941 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MUC1P15941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MUC1P15941 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MUC1P15941 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MUC1P15941 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MUC1P15941 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MUC1P15941 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MUC1P15941 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MUC1P15941 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MUC1P15941 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MUC1P15941 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MUC1P15941 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MUC1P15941 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MUC1P15941 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MUC1P15941 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MUC1P15941 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MUC1P15941 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MUC1P15941 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MUC1P15941 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MUC1P15941 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MUC1P15941 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MUC1P15941 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MUC1P15941 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MUC1P15941 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MUC1P15941 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MUC1P15941 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MUC1P15941 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MUC1P15941 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MUC1P15941 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MUC1P15941 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MUC1P15941 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms