Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VEGFAP15692 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VEGFAP15692 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VEGFAP15692 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VEGFAP15692 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms