Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRAFP15056 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAFP15056 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAFP15056 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAFP15056 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAFP15056 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAFP15056 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRAFP15056 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAFP15056 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAFP15056 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAFP15056 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRAFP15056 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRAFP15056 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAFP15056 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAFP15056 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAFP15056 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAFP15056 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRAFP15056 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRAFP15056 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAFP15056 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAFP15056 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAFP15056 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRAFP15056 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAFP15056 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAFP15056 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRAFP15056 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRAFP15056 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAFP15056 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAFP15056 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRAFP15056 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAFP15056 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAFP15056 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAFP15056 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAFP15056 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAFP15056 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRAFP15056 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRAFP15056 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRAFP15056 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAFP15056 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAFP15056 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAFP15056 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAFP15056 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAFP15056 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRAFP15056 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRAFP15056 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRAFP15056 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRAFP15056 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms