Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NID1P14543 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NID1P14543 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NID1P14543 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NID1P14543 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NID1P14543 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NID1P14543 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NID1P14543 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NID1P14543 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NID1P14543 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NID1P14543 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NID1P14543 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NID1P14543 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NID1P14543 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NID1P14543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NID1P14543 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NID1P14543 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NID1P14543 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NID1P14543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NID1P14543 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NID1P14543 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NID1P14543 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NID1P14543 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NID1P14543 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NID1P14543 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NID1P14543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NID1P14543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NID1P14543 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NID1P14543 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NID1P14543 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NID1P14543 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NID1P14543 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NID1P14543 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NID1P14543 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NID1P14543 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NID1P14543 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms