Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GFAPP14136 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFAPP14136 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFAPP14136 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFAPP14136 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GFAPP14136 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GFAPP14136 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFAPP14136 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GFAPP14136 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFAPP14136 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFAPP14136 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFAPP14136 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFAPP14136 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFAPP14136 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFAPP14136 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GFAPP14136 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GFAPP14136 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GFAPP14136 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFAPP14136 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFAPP14136 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFAPP14136 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFAPP14136 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFAPP14136 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFAPP14136 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFAPP14136 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFAPP14136 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFAPP14136 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFAPP14136 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFAPP14136 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFAPP14136 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFAPP14136 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFAPP14136 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFAPP14136 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFAPP14136 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFAPP14136 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFAPP14136 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFAPP14136 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFAPP14136 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFAPP14136 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFAPP14136 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms