Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ETFAP13804 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ETFAP13804 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ETFAP13804 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ETFAP13804 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ETFAP13804 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFAP13804 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFAP13804 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFAP13804 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFAP13804 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFAP13804 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFAP13804 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ETFAP13804 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFAP13804 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFAP13804 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFAP13804 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFAP13804 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFAP13804 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFAP13804 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ETFAP13804 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ETFAP13804 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ETFAP13804 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ETFAP13804 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ETFAP13804 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ETFAP13804 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFAP13804 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFAP13804 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFAP13804 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFAP13804 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ETFAP13804 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms