Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRG2P13727 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG2P13727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG2P13727 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG2P13727 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG2P13727 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG2P13727 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRG2P13727 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRG2P13727 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG2P13727 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG2P13727 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG2P13727 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG2P13727 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRG2P13727 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG2P13727 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG2P13727 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG2P13727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRG2P13727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG2P13727 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRG2P13727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRG2P13727 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRG2P13727 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRG2P13727 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRG2P13727 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRG2P13727 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRG2P13727 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRG2P13727 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRG2P13727 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRG2P13727 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRG2P13727 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRG2P13727 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRG2P13727 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRG2P13727 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRG2P13727 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRG2P13727 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRG2P13727 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRG2P13727 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRG2P13727 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRG2P13727 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRG2P13727 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRG2P13727 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms