Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COX4I1P13073 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX4I1P13073 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX4I1P13073 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms