Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP2P12643 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP2P12643 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP2P12643 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BMP2P12643 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BMP2P12643 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMP2P12643 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP2P12643 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP2P12643 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP2P12643 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP2P12643 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP2P12643 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BMP2P12643 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMP2P12643 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP2P12643 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP2P12643 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP2P12643 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BMP2P12643 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BMP2P12643 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BMP2P12643 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BMP2P12643 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMP2P12643 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP2P12643 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP2P12643 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP2P12643 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP2P12643 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMP2P12643 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BMP2P12643 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP2P12643 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP2P12643 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP2P12643 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP2P12643 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP2P12643 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMP2P12643 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP2P12643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP2P12643 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP2P12643 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP2P12643 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP2P12643 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMP2P12643 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP2P12643 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP2P12643 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP2P12643 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP2P12643 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP2P12643 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP2P12643 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP2P12643 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP2P12643 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP2P12643 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP2P12643 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP2P12643 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP2P12643 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP2P12643 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP2P12643 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP2P12643 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP2P12643 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP2P12643 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms