Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFHP12036 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFHP12036 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEFHP12036 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEFHP12036 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEFHP12036 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEFHP12036 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFHP12036 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFHP12036 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFHP12036 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFHP12036 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFHP12036 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFHP12036 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEFHP12036 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFHP12036 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFHP12036 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEFHP12036 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEFHP12036 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEFHP12036 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFHP12036 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFHP12036 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFHP12036 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFHP12036 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFHP12036 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFHP12036 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEFHP12036 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFHP12036 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFHP12036 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFHP12036 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFHP12036 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFHP12036 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEFHP12036 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEFHP12036 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEFHP12036 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEFHP12036 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEFHP12036 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFHP12036 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFHP12036 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEFHP12036 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms