Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPREB1P12018 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPREB1P12018 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms