Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
TOP2AP11388 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TOP2AP11388 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC42.33■■■■■ 4.37
TOP2AP11388 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC42.3■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TOP2AP11388 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TOP2AP11388 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms