Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1P11387 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1P11387 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1P11387 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1P11387 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1P11387 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP1P11387 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP1P11387 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP1P11387 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP1P11387 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP1P11387 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOP1P11387 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP1P11387 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP1P11387 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP1P11387 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP1P11387 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOP1P11387 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1P11387 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1P11387 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1P11387 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOP1P11387 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOP1P11387 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP1P11387 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP1P11387 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP1P11387 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP1P11387 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOP1P11387 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1P11387 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1P11387 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1P11387 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1P11387 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1P11387 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOP1P11387 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP1P11387 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP1P11387 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP1P11387 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOP1P11387 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOP1P11387 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1P11387 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1P11387 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1P11387 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1P11387 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOP1P11387 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1P11387 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1P11387 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOP1P11387 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP1P11387 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TOP1P11387 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1P11387 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1P11387 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOP1P11387 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP1P11387 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP1P11387 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP1P11387 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOP1P11387 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1P11387 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1P11387 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1P11387 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1P11387 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1P11387 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1P11387 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOP1P11387 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOP1P11387 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TOP1P11387 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP1P11387 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP1P11387 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP1P11387 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOP1P11387 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms