Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RARBP10826 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RARBP10826 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARBP10826 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RARBP10826 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARBP10826 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARBP10826 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARBP10826 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RARBP10826 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RARBP10826 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARBP10826 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RARBP10826 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARBP10826 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RARBP10826 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RARBP10826 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RARBP10826 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RARBP10826 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARBP10826 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARBP10826 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARBP10826 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RARBP10826 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARBP10826 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RARBP10826 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARBP10826 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARBP10826 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARBP10826 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARBP10826 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RARBP10826 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
RARBP10826 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RARBP10826 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RARBP10826 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARBP10826 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARBP10826 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARBP10826 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RARBP10826 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARBP10826 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARBP10826 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARBP10826 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARBP10826 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RARBP10826 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RARBP10826 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARBP10826 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARBP10826 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARBP10826 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARBP10826 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RARBP10826 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARBP10826 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARBP10826 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARBP10826 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RARBP10826 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RARBP10826 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARBP10826 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RARBP10826 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARBP10826 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARBP10826 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RARBP10826 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARBP10826 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RARBP10826 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms