Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TGFB3P10600 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGFB3P10600 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TGFB3P10600 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TGFB3P10600 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms