Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RD3LP0DJH9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RD3LP0DJH9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms