Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFC1P0CG37 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFC1P0CG37 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFC1P0CG37 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFC1P0CG37 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFC1P0CG37 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CFC1P0CG37 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CFC1P0CG37 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms