Protein–RNA interactions for Protein: P0CB48

UBTFL6, Putative upstream-binding factor 1-like protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL6P0CB48 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBTFL6P0CB48 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBTFL6P0CB48 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.5 ms