Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACAA1P09110 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACAA1P09110 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACAA1P09110 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms