Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT7P08729 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT7P08729 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT7P08729 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT7P08729 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT7P08729 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT7P08729 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT7P08729 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT7P08729 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT7P08729 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT7P08729 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT7P08729 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT7P08729 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT7P08729 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT7P08729 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT7P08729 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT7P08729 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT7P08729 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT7P08729 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT7P08729 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT7P08729 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT7P08729 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT7P08729 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT7P08729 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT7P08729 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT7P08729 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT7P08729 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT7P08729 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT7P08729 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT7P08729 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT7P08729 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT7P08729 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT7P08729 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT7P08729 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT7P08729 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT7P08729 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT7P08729 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT7P08729 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT7P08729 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT7P08729 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT7P08729 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT7P08729 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT7P08729 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT7P08729 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT7P08729 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT7P08729 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT7P08729 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT7P08729 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT7P08729 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT7P08729 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT7P08729 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT7P08729 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT7P08729 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT7P08729 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT7P08729 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT7P08729 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT7P08729 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT7P08729 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT7P08729 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms